通過(guò)BAC修飾(BAC modification/recombineering),我們可以將報(bào)告基因放置在BAC特定的調(diào)控序列之后,也可以將點(diǎn)突變引入目的基因、或是將BAC上的片段轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒載體上以及在BAC骨架上添加篩選標(biāo)記等。
以下是可供選擇的服務(wù)類型,按照操作步驟定義的價(jià)格和周期請(qǐng)點(diǎn)擊了解更多>>
服務(wù)類型 | 價(jià)格 | 周期 | 備注 |
基因敲入 |
EGFP, mCherry, LacZ, GCaMP6s, Luciferase, DTR | 請(qǐng)咨詢 | 42-63 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達(dá)盒最終會(huì)被刪除。 |
請(qǐng)咨詢 | 63-84 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達(dá)盒最終會(huì)被刪除;piggyBac ITRs會(huì)被添加到BAC骨架上。 |
Cre, CreERT2 | 請(qǐng)咨詢 | 98-119 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達(dá)盒和BAC骨架上的loxP位點(diǎn)最終會(huì)被刪除。 |
請(qǐng)咨詢 | 98-119 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達(dá)盒和BAC骨架上的loxP位點(diǎn)最終會(huì)被刪除;piggyBac ITRs會(huì)被添加到BAC骨架上。 |
其他DNA片段 | 請(qǐng)咨詢 | 請(qǐng)咨詢 | |
點(diǎn)突變 |
常規(guī)點(diǎn)突變 | 請(qǐng)咨詢 | 49-77 天 | 運(yùn)用“兩步法BAC修飾”。 |
請(qǐng)咨詢 | 70-98 天 | 運(yùn)用“兩步法BAC修飾”;piggyBac ITRs會(huì)被添加到BAC骨架上。 |
刪除BAC骨架上的loxP位點(diǎn) |
pBACe3.6 | 請(qǐng)咨詢 | 63-84 天 | pBACe3.6骨架上的loxP和loxP511位點(diǎn)可能與Cre相互作用,刪除BAC骨架上的loxP位點(diǎn)避免基因重組。 |
請(qǐng)咨詢 | 63-84 天 | BAC骨架上的loxP位點(diǎn)最終會(huì)被刪除;piggyBac ITRs會(huì)被添加到BAC骨架上。 |
其他BAC骨架 | 請(qǐng)咨詢 | 請(qǐng)咨詢 | |
將DNA片段從BAC轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒載體上 |
pStart-K | 請(qǐng)咨詢 | 35-49 天 | 轉(zhuǎn)移的片段大小通常不超過(guò)30 kb。 |
pStart-K-ITR | 請(qǐng)咨詢 | 35-49 天 | 轉(zhuǎn)移的片段大小通常不超過(guò)30 kb; 質(zhì)粒載體骨架包含piggyBac ITR。 |
其他質(zhì)粒載體 | 請(qǐng)咨詢 | 請(qǐng)咨詢 | |
在BAC骨架上添加篩選標(biāo)記 |
Neo, Puro, piggyBac ITRs | 請(qǐng)咨詢 | 35-42 天 | 這些元件會(huì)被添加到BAC骨架loxP位點(diǎn)上。 |
其他元件 | 請(qǐng)咨詢 | 請(qǐng)咨詢 | |
備注:
a. 周期的定義:從接受訂單到發(fā)貨的時(shí)間,不包括客戶準(zhǔn)備材料所需要的時(shí)間(例如:BAC克隆的購(gòu)買)。b. 上述價(jià)格包含從BACPAC中購(gòu)買BAC克隆的費(fèi)用,最終報(bào)價(jià)可能因引入序列的復(fù)雜性而異。c. 此服務(wù)僅適用于在其骨架中包含loxP位點(diǎn)的BAC,BACPAC資源中心的大多數(shù)BAC都包含loxP位點(diǎn)。如何獲取BAC修飾服務(wù)?
您只需點(diǎn)擊主頁(yè)上的“發(fā)送設(shè)計(jì)咨詢”按鈕,就可以在線提交您的BAC修飾服務(wù)需求。您可以這樣描述您的需求:“我想在這個(gè)基因的啟動(dòng)子之后放置一個(gè)lacZ報(bào)告基因”。我們經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員將免費(fèi)為您設(shè)計(jì)一個(gè)可行的方案,并向您發(fā)送包含方案、報(bào)價(jià)和周期等相關(guān)信息的鏈接。如果您對(duì)該方案滿意,可直接將其添加到購(gòu)物車中,并根據(jù)說(shuō)明下單。
服務(wù)說(shuō)明
免費(fèi)設(shè)計(jì)BAC修飾方案
VectorBuilder經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì)將根據(jù)您的需求,免費(fèi)為您設(shè)計(jì)一個(gè)詳盡而高效的BAC修飾方案。
為您購(gòu)買BAC
如果您知道您需要的BAC的ID號(hào),請(qǐng)?zhí)峁┙o我們,我們將為您購(gòu)買。如果對(duì)使用的BAC有疑惑,我們也可以根據(jù)您研究的基因?yàn)槟业胶线m的BAC。絕大多數(shù)BAC可從CHORI 的BACPAC資源中心獲取,但某些BAC需要從其他供應(yīng)商購(gòu)買。您也可以直接給我們寄送含有BAC的大腸桿菌。
“一步法BAC修飾”
既可用于引入大片段如在某個(gè)基因的啟動(dòng)子后面加上用于示蹤的報(bào)告基因(圖1),也可引入小改變,如點(diǎn)突變(圖2)。
大片段的引入(圖1):片段包含有目的基因(GOI)(例如LacZ或GFP報(bào)告基因)、兩側(cè)為FRT位點(diǎn)的藥物篩選表達(dá)框,其兩端具有與重組區(qū)域同源的同源臂。通過(guò)同源重組來(lái)替代BAC上的內(nèi)源區(qū)域,藥物篩選表達(dá)盒可用于鑒定成功修飾的BAC克隆,可通過(guò)Flp介導(dǎo)的重組刪除該表達(dá)盒,只留下一個(gè)FRT位點(diǎn)。
圖1. “一步法BAC修飾”示意圖:在啟動(dòng)子后面引入目的基因(GOI)(如LacZ或GFP報(bào)告基因)
引入點(diǎn)突變(圖2):片段包含突變區(qū)域、兩側(cè)為FRT位點(diǎn)的藥物篩選表達(dá)框,其兩端具有與重組區(qū)域同源的同源臂。通過(guò)同源重組取代BAC上的內(nèi)源區(qū)域,最后通過(guò)Flp介導(dǎo)的重組刪除該表達(dá)盒,只留下一個(gè)FRT位點(diǎn)。FRT位點(diǎn)被認(rèn)為是“瘢痕”序列,因?yàn)樾揎椇蟮腂AC除了所需的點(diǎn)突變之外,還攜帶這個(gè)殘留的FRT。為了不影響基因功能,該瘢痕序列要放置在基因的非功能區(qū)域,如內(nèi)含子或UTR區(qū)。
圖2. “一步法BAC修飾”示意圖:在基因的第一外顯子中引入點(diǎn)突變并將FRT序列放置在下游內(nèi)含子中
“兩步法BAC修飾”
“兩步法BAC修飾”用于將微小的變化(如點(diǎn)突變)引入BAC,而不留下FRT瘢痕序列(圖3)。該方法適用于以下情況,即在預(yù)期突變位點(diǎn)的附近,沒(méi)有合適的空間放置殘留的FRT瘢痕序列。例如,如果要修飾的基因是非常大的單外顯子基因,并且所需的突變位點(diǎn)位于基因的中間,則在點(diǎn)突變附近沒(méi)有合適的位置來(lái)放置瘢痕序列。在這種情況下,應(yīng)該使用兩步法,該方法利用表達(dá)藥物篩選標(biāo)記的基因片段進(jìn)行陽(yáng)性和陰性篩選(圖3)。第一步,使用該基因片段進(jìn)行同源重組來(lái)替代內(nèi)源靶區(qū)域,通過(guò)藥物陽(yáng)性篩選獲得成功重組的BAC;第二步,通過(guò)同源重組,使用包含突變位點(diǎn)的片段替代藥物篩選基因片段,利用陰性選擇篩出實(shí)現(xiàn)點(diǎn)突變的BAC。
圖3. “兩步法BAC修飾”示意圖:在大的單個(gè)外顯子基因中引入點(diǎn)突變而不留下瘢痕序列
將篩選標(biāo)記添加到BAC骨架上
使用該類BAC轉(zhuǎn)染到細(xì)胞時(shí),BAC骨架上的篩選標(biāo)記將有利于其在細(xì)胞中被篩選或示蹤,這將有利于通過(guò)藥物篩選分離含有穩(wěn)定整合BAC的細(xì)胞。
將BAC上的片段轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒載體上
我們可以將BAC的任何區(qū)域(可達(dá)60 kb)轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒載體上單獨(dú)進(jìn)行研究。例如,如果利用整個(gè)BAC構(gòu)建轉(zhuǎn)基因小鼠以研究在BAC上某個(gè)基因的功能,同一BAC上的其他基因可能會(huì)對(duì)研究結(jié)果有影響,而將目的基因單獨(dú)分離到質(zhì)粒上并使用該質(zhì)粒構(gòu)建轉(zhuǎn)基因小鼠可以避免這個(gè)問(wèn)題。另外,在技術(shù)層面,使用質(zhì)粒比使用BAC更加簡(jiǎn)單。
BAC修飾的鑒定
BAC修飾區(qū)域?qū)⑼ㄟ^(guò)測(cè)序鑒定。由于重復(fù)序列的存在,BAC可能會(huì)發(fā)生片段缺失。為了降低這種可能性,我們將重新轉(zhuǎn)化修飾后的BAC,并挑選獲得單克隆,通過(guò)在整個(gè)BAC上進(jìn)行多個(gè)位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增來(lái)確認(rèn)其沒(méi)有發(fā)生大片段缺失。
價(jià)格和周期
該服務(wù)的最終交付形式是含有經(jīng)修飾和驗(yàn)證的BAC的大腸桿菌。由于該服務(wù)涉及的工作量大,所以成本相對(duì)較高,但外包給我們比自己做更實(shí)惠。由于方案復(fù)雜和易出錯(cuò)的性質(zhì),大多數(shù)人親自做可能需要花費(fèi)長(zhǎng)達(dá)一年的時(shí)間,可能需要經(jīng)過(guò)不斷的試劑采購(gòu)、學(xué)習(xí)和查找問(wèn)題才能成功。為了讓您更好地分配和節(jié)省時(shí)間,請(qǐng)把繁瑣的工作交給我們。
BAC修飾服務(wù)的價(jià)格和周期見(jiàn)下表:
服務(wù)內(nèi)容 | 價(jià)格 | 周期* |
設(shè)計(jì)BAC修飾方案 | 免費(fèi) | 1-4 天 |
購(gòu)買BAC | ¥1,380 | 2 周 |
“一步法BAC修飾”(不刪除藥物篩選表達(dá)盒) | ¥13,650起** | 2-4 周 |
可選:刪除“一步法BAC修飾”中引入的藥物篩選表達(dá)盒 | ¥2,450 | 1-2 周 |
“兩步法BAC修飾” | ¥36,030起** | 2-4 周 |
添加藥物篩選或示蹤標(biāo)記到BAC骨架*** | ¥8,030 | 5-7 周 |
將BAC上的片段轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒載體上 | ¥17,850 | 2-4 周 |
BAC修飾的鑒定 | 免費(fèi) | 1 周 |
* 周期的定義:從接受訂單到發(fā)貨的時(shí)間,不包括客戶準(zhǔn)備材料所需要的時(shí)間(例如BAC克隆的購(gòu)買和郵寄)。
** 最終價(jià)格可能因引入的序列復(fù)雜程度而異。
*** 此服務(wù)僅適用于在骨架上有l(wèi)oxP位點(diǎn)的BAC。BACPAC資源中心的大多數(shù)BAC都含有l(wèi)oxP位點(diǎn)。