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載體設(shè)計與克隆
重組病毒包裝
特色服務(wù)
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產(chǎn)品
COVID-19
冠狀病毒解決方案
進(jìn)一步了解 >> 我們的質(zhì)量體系通過ISO 9001認(rèn)證。這些產(chǎn)品是在我們先進(jìn)的設(shè)施中嚴(yán)格控制下生成的。

CRISPR文庫構(gòu)建

云舟生物專注于高度復(fù)雜的CRISPR文庫設(shè)計，以滿足各種大規(guī)模和小規(guī)模功能篩選的實驗需求。CRISPR文庫可以以E. coli菌株、質(zhì)粒DNA或重組病毒的形式交付。我們使用下一代測序（NGS）全面驗證定制文庫，能讓您真正了解所購買文庫的組分和質(zhì)量。

亮點

  • 高多樣性： 我們的CRISPR文庫擁有從數(shù)百至106的高度復(fù)雜度。
  • CRISPR文庫設(shè)計經(jīng)驗豐富： 我們對于多種類型的CRISPR文庫針對不同種類的篩選策略擁有豐富的設(shè)計經(jīng)驗，包括但不限于CRISPR KO（單gRNA或雙gRNA）、CRISPRa、CRISPRi、單細(xì)胞CRISPR技術(shù)、CRISPR barcoding技術(shù)等。
  • 高度靈活的載體設(shè)計： 我們可根據(jù)您的需求為您設(shè)計合適的文庫載體，使用不同的遞送系統(tǒng)、啟動子、標(biāo)記基因、barcode等。
  • 高質(zhì)量病毒包裝： 我們可包裝多種病毒系統(tǒng)，周期短、性價比高
  • 高覆蓋率、高均一性： 我們設(shè)計的載體變體其文庫可達(dá)>98%的覆蓋率
服務(wù)詳情
landing page workflow
價格與周期

表1 文庫構(gòu)建服務(wù)價格與周期

服務(wù)簡述價格（CNY）周期
設(shè)計文庫構(gòu)建策略CRISPR載體骨架設(shè)計、gRNA序列設(shè)計免費(fèi)1-4 天
文庫質(zhì)?？寺。ò╫ligo合成和NGS驗證）見表2。
文庫的病毒包裝點擊此處了解更多病毒包裝服務(wù)信息。文庫質(zhì)粒的病毒病毒包裝價格是常規(guī)單質(zhì)粒載體包裝的1.5倍。
功能篩選樣品的NGS測序分析包括細(xì)胞樣品基因組的NGS文庫制備、lllumina測序（>500×覆蓋率）和數(shù)據(jù)分析。￥ 2,240/樣本3-5 周

表2 文庫復(fù)雜度與文庫載體克隆價格

文庫復(fù)雜度價格（CNY）周期
單gRNA
0 ~ 5×103￥ 16,100起5-8 周
5×103 ~ 104￥ 31,500起
104 ~ 5×104￥ 38,500起6-10 周
5×104 ~ 105￥ 52,500起
>1×105請咨詢
雙gRNA
0 ~ 5×103￥ 16,100起9-13 周
5×103 ~ 104￥ 45,500起
104 ~ 5×104￥ 56,000起
5×104 ~ 105￥ 70,000起
>105請咨詢
技術(shù)詳情
CRISPR 篩選策略

CRISPR文庫是一種強(qiáng)大的工具，可用于針對特定通路、疾病、細(xì)胞對藥物治療的反應(yīng)、發(fā)育過程、基因調(diào)控等編碼或非編碼區(qū)域的大規(guī)模或全基因組功能篩選。表3展示了常用的CRISPR篩選方法并進(jìn)行了比較。

表3 CRISPR篩選方法比較

篩選策略機(jī)制靶向區(qū)域應(yīng)用
CRISPR KO野生型Cas9或Cas9核酸內(nèi)切酶切割DNA。當(dāng)細(xì)胞試圖修復(fù)DNA斷裂時，會在靶位點引入隨機(jī)突變。主要為編碼區(qū)域主要用于編碼基因的功能篩選
CRISPRa酶切活性失活的突變型Cas9（dCas9）融合轉(zhuǎn)錄激活因子（VP64），結(jié)合靶位點調(diào)控激活基因表達(dá)。通常為啟動子區(qū)域或者其它非編碼調(diào)控區(qū)域編碼基因的功能獲得型篩選、非編碼區(qū)域的調(diào)控功能篩選
CRISPRi酶切活性失活的突變型Cas9（dCas9）融合轉(zhuǎn)錄抑制因子（KRAB），結(jié)合靶位點調(diào)控抑制基因表達(dá)。通常為啟動子區(qū)域或者其它非編碼調(diào)控區(qū)域編碼基因的功能缺失型篩選、非編碼區(qū)域的調(diào)控功能篩選
實驗數(shù)據(jù)
Complexity, coverage, and alignment rate of CRISPR libraries constructed by VectorBuilder

圖1 云舟生物CRISPR文庫的復(fù)雜度、覆蓋率和序列比對的一致性。來自于云舟生物構(gòu)建的CRISPR文庫的數(shù)據(jù)以無偏好方式進(jìn)行收集和分析。（A）文庫復(fù)雜度范圍從102到>105。（B）gRNA的覆蓋率和讀取的比對率均很高，表明我們的文庫具有出色的覆蓋率和低錯誤率。

Distribution of gRNA representation in a pooled library

圖2 包含7.7×104個gRNA的文庫的gRNA分布統(tǒng)計。gRNA read counts使用NGS庫大?。ㄒ磺freads）進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，并以log2尺度繪制。NGS測序深度為300×。

客戶提供文庫質(zhì)粒

如果您需要使用您的文庫質(zhì)粒構(gòu)建文庫，請按照外來物品接收指南將質(zhì)粒寄送給我們。請嚴(yán)格按照我們的指南來進(jìn)行裝運(yùn)以免造成物品的任何延誤和損壞?？蛻籼峁┑乃胁牧暇杞?jīng)過QC檢測，每一份材料附加檢測費(fèi)用。請注意，客戶提供物品接收并通過QC之后生產(chǎn)才正式開始。對于使用客戶文庫質(zhì)粒構(gòu)建的文庫，我們無法保證文庫的多樣性和均一性。

文檔

使用說明書

Pooled Lentivirus Libraries for In Vitro Screening

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