通過BAC修飾(BAC modification/recombineering),我們可以將報告基因放置在BAC特定的調控序列之后,也可以將點突變引入目的基因、或是將BAC上的片段轉移到質粒載體上以及在BAC骨架上添加篩選標記等。
以下是可供選擇的服務類型,按照操作步驟定義的價格和周期請點擊了解更多>>
服務類型 | 價格 | 周期 | 備注 |
基因敲入 |
EGFP, mCherry, LacZ, GCaMP6s, Luciferase, DTR | 請咨詢 | 42-63 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達盒最終會被刪除。 |
請咨詢 | 63-84 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達盒最終會被刪除;piggyBac ITRs會被添加到BAC骨架上。 |
Cre, CreERT2 | 請咨詢 | 98-119 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達盒和BAC骨架上的loxP位點最終會被刪除。 |
請咨詢 | 98-119 天 | “一步法BAC修飾”中引入的抗藥性篩選表達盒和BAC骨架上的loxP位點最終會被刪除;piggyBac ITRs會被添加到BAC骨架上。 |
其他DNA片段 | 請咨詢 | 請咨詢 | |
點突變 |
常規(guī)點突變 | 請咨詢 | 49-77 天 | 運用“兩步法BAC修飾”。 |
請咨詢 | 70-98 天 | 運用“兩步法BAC修飾”;piggyBac ITRs會被添加到BAC骨架上。 |
刪除BAC骨架上的loxP位點 |
pBACe3.6 | 請咨詢 | 63-84 天 | pBACe3.6骨架上的loxP和loxP511位點可能與Cre相互作用,刪除BAC骨架上的loxP位點避免基因重組。 |
請咨詢 | 63-84 天 | BAC骨架上的loxP位點最終會被刪除;piggyBac ITRs會被添加到BAC骨架上。 |
其他BAC骨架 | 請咨詢 | 請咨詢 | |
將DNA片段從BAC轉移到質粒載體上 |
pStart-K | 請咨詢 | 35-49 天 | 轉移的片段大小通常不超過30 kb。 |
pStart-K-ITR | 請咨詢 | 35-49 天 | 轉移的片段大小通常不超過30 kb; 質粒載體骨架包含piggyBac ITR。 |
其他質粒載體 | 請咨詢 | 請咨詢 | |
在BAC骨架上添加篩選標記 |
Neo, Puro, piggyBac ITRs | 請咨詢 | 35-42 天 | 這些元件會被添加到BAC骨架loxP位點上。 |
其他元件 | 請咨詢 | 請咨詢 | |
備注:
a. 周期的定義:從接受訂單到發(fā)貨的時間,不包括客戶準備材料所需要的時間(例如:BAC克隆的購買)。b. 上述價格包含從BACPAC中購買BAC克隆的費用,最終報價可能因引入序列的復雜性而異。c. 此服務僅適用于在其骨架中包含loxP位點的BAC,BACPAC資源中心的大多數(shù)BAC都包含loxP位點。如何獲取BAC修飾服務?
您只需點擊主頁上的“發(fā)送設計咨詢”按鈕,就可以在線提交您的BAC修飾服務需求。您可以這樣描述您的需求:“我想在這個基因的啟動子之后放置一個lacZ報告基因”。我們經驗豐富的技術人員將免費為您設計一個可行的方案,并向您發(fā)送包含方案、報價和周期等相關信息的鏈接。如果您對該方案滿意,可直接將其添加到購物車中,并根據(jù)說明下單。
服務說明
免費設計BAC修飾方案
VectorBuilder經驗豐富的技術團隊將根據(jù)您的需求,免費為您設計一個詳盡而高效的BAC修飾方案。
為您購買BAC
如果您知道您需要的BAC的ID號,請?zhí)峁┙o我們,我們將為您購買。如果對使用的BAC有疑惑,我們也可以根據(jù)您研究的基因為您找到合適的BAC。絕大多數(shù)BAC可從CHORI 的BACPAC資源中心獲取,但某些BAC需要從其他供應商購買。您也可以直接給我們寄送含有BAC的大腸桿菌。
“一步法BAC修飾”
既可用于引入大片段如在某個基因的啟動子后面加上用于示蹤的報告基因(圖1),也可引入小改變,如點突變(圖2)。
大片段的引入(圖1):片段包含有目的基因(GOI)(例如LacZ或GFP報告基因)、兩側為FRT位點的藥物篩選表達框,其兩端具有與重組區(qū)域同源的同源臂。通過同源重組來替代BAC上的內源區(qū)域,藥物篩選表達盒可用于鑒定成功修飾的BAC克隆,可通過Flp介導的重組刪除該表達盒,只留下一個FRT位點。
圖1. “一步法BAC修飾”示意圖:在啟動子后面引入目的基因(GOI)(如LacZ或GFP報告基因)
引入點突變(圖2):片段包含突變區(qū)域、兩側為FRT位點的藥物篩選表達框,其兩端具有與重組區(qū)域同源的同源臂。通過同源重組取代BAC上的內源區(qū)域,最后通過Flp介導的重組刪除該表達盒,只留下一個FRT位點。FRT位點被認為是“瘢痕”序列,因為修飾后的BAC除了所需的點突變之外,還攜帶這個殘留的FRT。為了不影響基因功能,該瘢痕序列要放置在基因的非功能區(qū)域,如內含子或UTR區(qū)。
圖2. “一步法BAC修飾”示意圖:在基因的第一外顯子中引入點突變并將FRT序列放置在下游內含子中
“兩步法BAC修飾”
“兩步法BAC修飾”用于將微小的變化(如點突變)引入BAC,而不留下FRT瘢痕序列(圖3)。該方法適用于以下情況,即在預期突變位點的附近,沒有合適的空間放置殘留的FRT瘢痕序列。例如,如果要修飾的基因是非常大的單外顯子基因,并且所需的突變位點位于基因的中間,則在點突變附近沒有合適的位置來放置瘢痕序列。在這種情況下,應該使用兩步法,該方法利用表達藥物篩選標記的基因片段進行陽性和陰性篩選(圖3)。第一步,使用該基因片段進行同源重組來替代內源靶區(qū)域,通過藥物陽性篩選獲得成功重組的BAC;第二步,通過同源重組,使用包含突變位點的片段替代藥物篩選基因片段,利用陰性選擇篩出實現(xiàn)點突變的BAC。
圖3. “兩步法BAC修飾”示意圖:在大的單個外顯子基因中引入點突變而不留下瘢痕序列
將篩選標記添加到BAC骨架上
使用該類BAC轉染到細胞時,BAC骨架上的篩選標記將有利于其在細胞中被篩選或示蹤,這將有利于通過藥物篩選分離含有穩(wěn)定整合BAC的細胞。
將BAC上的片段轉移到質粒載體上
我們可以將BAC的任何區(qū)域(可達60 kb)轉移到質粒載體上單獨進行研究。例如,如果利用整個BAC構建轉基因小鼠以研究在BAC上某個基因的功能,同一BAC上的其他基因可能會對研究結果有影響,而將目的基因單獨分離到質粒上并使用該質粒構建轉基因小鼠可以避免這個問題。另外,在技術層面,使用質粒比使用BAC更加簡單。
BAC修飾的鑒定
BAC修飾區(qū)域將通過測序鑒定。由于重復序列的存在,BAC可能會發(fā)生片段缺失。為了降低這種可能性,我們將重新轉化修飾后的BAC,并挑選獲得單克隆,通過在整個BAC上進行多個位點的PCR擴增來確認其沒有發(fā)生大片段缺失。
價格和周期
該服務的最終交付形式是含有經修飾和驗證的BAC的大腸桿菌。由于該服務涉及的工作量大,所以成本相對較高,但外包給我們比自己做更實惠。由于方案復雜和易出錯的性質,大多數(shù)人親自做可能需要花費長達一年的時間,可能需要經過不斷的試劑采購、學習和查找問題才能成功。為了讓您更好地分配和節(jié)省時間,請把繁瑣的工作交給我們。
BAC修飾服務的價格和周期見下表:
服務內容 | 價格 | 周期* |
設計BAC修飾方案 | 免費 | 1-4 天 |
購買BAC | ¥1,380 | 2 周 |
“一步法BAC修飾”(不刪除藥物篩選表達盒) | ¥13,650起** | 2-4 周 |
可選:刪除“一步法BAC修飾”中引入的藥物篩選表達盒 | ¥2,450 | 1-2 周 |
“兩步法BAC修飾” | ¥36,030起** | 2-4 周 |
添加藥物篩選或示蹤標記到BAC骨架*** | ¥8,030 | 5-7 周 |
將BAC上的片段轉移到質粒載體上 | ¥17,850 | 2-4 周 |
BAC修飾的鑒定 | 免費 | 1 周 |
* 周期的定義:從接受訂單到發(fā)貨的時間,不包括客戶準備材料所需要的時間(例如BAC克隆的購買和郵寄)。
** 最終價格可能因引入的序列復雜程度而異。
*** 此服務僅適用于在骨架上有l(wèi)oxP位點的BAC。BACPAC資源中心的大多數(shù)BAC都含有l(wèi)oxP位點。