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進(jìn)一步了解 >> 我們的質(zhì)量體系通過ISO 9001認(rèn)證。這些產(chǎn)品是在我們先進(jìn)的設(shè)施中嚴(yán)格控制下生成的。

CRISPR IVT RNA制備

采用CRISPR IVT RNA進(jìn)行基因編輯正迅速成為一種流行的基因編輯方法,其優(yōu)點(diǎn)包括轉(zhuǎn)基因表達(dá)不依賴細(xì)胞類型啟動(dòng)子、無基因組整合風(fēng)險(xiǎn)、且瞬時(shí)表達(dá)可以減少脫靶效應(yīng)等。此外,由于Cas9 mRNA和gRNA可以一同被封裝在脂質(zhì)納米顆粒中,有利于實(shí)現(xiàn)體外和體內(nèi)高效的基因遞送和基因編輯。云舟生物可提供一系列與CRISPR基因編輯相關(guān)的IVT RNA產(chǎn)品,包括Cas9 mRNA、Cas9-ABE mRNA和gRNA。如果您需要開展CRISPR實(shí)驗(yàn),可點(diǎn)擊此處與我們的RNA設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)聯(lián)系。

亮點(diǎn)
fast TAT from cloning to LNP encapsulation

質(zhì)量穩(wěn)定、周期短、有競爭力的定價(jià)。

Experts in RNA development

針對實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析和難題解疑的有力技術(shù)支持。

LNP encapsulation

Cas9 mRNA和gRNA共同封裝LNP,實(shí)現(xiàn)快速高效的基因編輯。

crispr

Cas9序列經(jīng)過優(yōu)化,表達(dá)效率高,可供授權(quán)。

服務(wù)詳情
技術(shù)詳情

CRISPR IVT RNA可應(yīng)用于包括體外和體內(nèi)基因編輯以及CRISPR介導(dǎo)的堿基編輯等多種體系。以下數(shù)據(jù)驗(yàn)證了CRISPR IVT RNA在多種實(shí)驗(yàn)中的有效性。

HiExpress™ hSpCas9 IVT mRNA

云舟生物開發(fā)的HiExpressTM hSpCas9 IVT mRNA 經(jīng)過序列優(yōu)化,與其它人源化Cas9突變體相比具有更高的表達(dá)量,因此在細(xì)胞中達(dá)到相近的編輯效率所需的mRNA量更少,非常適合用于涉及療法開發(fā)和生物技術(shù)應(yīng)用的基因編輯實(shí)驗(yàn)。如需了解關(guān)于此產(chǎn)品授權(quán)情況的更多信息,請聯(lián)系我們。

Validation_of_hSpCas9_mRNA_knockout_with_dual_gRNAs

圖5 云舟生物開發(fā)的HiExpress™ hSpCas9 IVT mRNA具有很高的表達(dá)和編輯效率。使用1 ug hSpCas9 IVT mRNA和經(jīng)過密碼子優(yōu)化的HiExpress™ hSpCas9 IVT mRNA分別轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞。轉(zhuǎn)染后24 h,對以上兩組實(shí)驗(yàn)組與非處理對照(NC)進(jìn)行(A)Western blot分析,并對(B)Cas9相對表達(dá)水平進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化定量。(C)使用1,000 ng gRNA與指示劑量的hSpCas9 IVT mRNA、HiExpress™ hSpCas9 IVT mRNA分別共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞。轉(zhuǎn)染后24 h,T7E1酶切法檢測基因編輯效率。藍(lán)色星號所指為完整的PCR擴(kuò)增子,粉色箭頭指所指為T7E1酶切產(chǎn)生的片段。

常見問題解答

CRISPR-Cas9可以通過多種方法遞送,包括質(zhì)粒、重組病毒、gRNA-Cas9 RNP復(fù)合物,以及gRNA和Cas9 IVT mRNA的混合物,而這些方法都有各自的優(yōu)勢和局限性。研究人員應(yīng)選擇適合自己實(shí)驗(yàn)應(yīng)用的遞送方法,旨在通過最小化脫靶效應(yīng)和不良效果獲得最佳的編輯效率,而IVT RNA正迅速成為其中一種效果良好的基因編輯工具。

質(zhì)粒的大量制備一般成本較低,并且可以通過技術(shù)相對簡單的化學(xué)轉(zhuǎn)染和電穿孔進(jìn)行遞送。然而,由于這些遞送方式的自身特性,使得質(zhì)粒載體主要限于體外應(yīng)用。此外,質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的效率在不同細(xì)胞類型之間差異很大,且轉(zhuǎn)基因表達(dá)依賴于特定細(xì)胞類型的啟動(dòng)子活性,而這在某些系統(tǒng)中可能會(huì)降低轉(zhuǎn)基因的表達(dá)效率。因此,質(zhì)粒系統(tǒng)傾向配合使用高活性的啟動(dòng)子以確保Cas9的高水平表達(dá),但是這也會(huì)增加脫靶效應(yīng)和質(zhì)粒DNA隨機(jī)整合到宿主基因組中的風(fēng)險(xiǎn)。

重組病毒是遞送CRISPR-Cas9的另一種常用工具,特別適合難以轉(zhuǎn)染的細(xì)胞類型,并且可以創(chuàng)建穩(wěn)定表達(dá)Cas9的細(xì)胞系以用于需要導(dǎo)入多個(gè)gRNA的實(shí)驗(yàn)。然而,該系統(tǒng)同樣與質(zhì)粒遞送系統(tǒng)一樣存在諸多相同的限制,包括依賴特定細(xì)胞類型的啟動(dòng)子,以及由于長期表達(dá)Cas9而導(dǎo)致的脫靶效應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)增加。此外,重組病毒也會(huì)帶來較高的插入突變風(fēng)險(xiǎn),特別是在逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒系統(tǒng)中的Cas9基因整合細(xì)胞基因組的時(shí)候。

通過gRNA-Cas9 RNP復(fù)合物遞送可以繞過質(zhì)粒和重組病毒系統(tǒng)的許多限制,同時(shí)實(shí)現(xiàn)快速編輯,因?yàn)椴恍枰M(jìn)行轉(zhuǎn)錄或翻譯。然而,由于需要使用電穿孔方式實(shí)現(xiàn)高效的遞送,這種方法同樣主要限于體外應(yīng)用。通過這種方法進(jìn)行的基因編輯發(fā)生得很快,但隨著Cas9在宿主細(xì)胞中被降解,編輯效果會(huì)迅速減弱,因此常受到可用的Cas9蛋白的類型限制。

與上述方法相比,使用gRNA和Cas9 IVT mRNA的混合物進(jìn)行遞送當(dāng)前已被認(rèn)為同樣是一種高效的基因編輯方法,具有最小化脫靶效應(yīng)的優(yōu)點(diǎn)。該方法中,gRNA和Cas9 IVT mRNA一起被封裝在脂質(zhì)納米顆?;蚧瘜W(xué)轉(zhuǎn)染試劑中,使得該系統(tǒng)適用于體外和體內(nèi)應(yīng)用,并且無需擔(dān)心存在整合宿主基因組的風(fēng)險(xiǎn)。此外,由于不需要進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)基因的表達(dá)不依賴于特定的細(xì)胞類型啟動(dòng)子活性,翻譯的發(fā)生也相對更快,從而實(shí)現(xiàn)快速且高效的基因編輯。與gRNA-Cas9 RNP復(fù)合物相比,mRNA形式的Cas9基因具有更長的表達(dá)時(shí)長,可達(dá)成充分的基因編輯效果。然而,mRNA最終也會(huì)被降解,編輯僅暫時(shí)發(fā)生過,從而限制了脫靶效應(yīng)的影響。

總而言之,通過質(zhì)粒、重組病毒和gRNA-Cas9 RNP復(fù)合物遞送CRISPR-Cas9組分的方法均存在較多限制,對它們在許多場景中的應(yīng)用造成了阻礙。這些方法具有明顯的缺點(diǎn),包括相對有限的編輯效率、較高的脫靶效應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)以及插入突變的潛在風(fēng)險(xiǎn)等。相對地,基于gRNA和Cas9 IVT mRNA混合物的遞送方式具有諸多優(yōu)點(diǎn)和較少的限制,是一種高效的基因編輯方法,應(yīng)更多地被考慮用于基因編輯實(shí)驗(yàn)。

對于CRISPR介導(dǎo)的基因編輯,Cas9核酸酶通過特異性的gRNA作用至靶位點(diǎn)以產(chǎn)生DNA切割。在大多數(shù)情況下,為了實(shí)現(xiàn)簡單的基因敲除,可以將單個(gè)gRNA與Cas9共同使用以產(chǎn)生DSB,然后通過NHEJ進(jìn)行低效率的DNA修復(fù),從而導(dǎo)致序列發(fā)生永久性突變,比如產(chǎn)生基因的小片段插入或堿基缺失。這類突變的一部分會(huì)導(dǎo)致基因的閱讀框移碼、出現(xiàn)提前終止密碼子等,最終導(dǎo)致目的基因的功能喪失。

雙gRNA則一般用于結(jié)合Cas9(D10A)切口酶對靶位點(diǎn)的兩條反向DNA鏈進(jìn)行切割。在這種方法中,切口酶將在兩條鏈上產(chǎn)生單鏈切割,每一條鏈上的切割位點(diǎn)通過兩條gRNA中的一條引導(dǎo),然后在靶位點(diǎn)產(chǎn)生DSB。一般來說,這種方法減少潛在的脫靶效應(yīng),因?yàn)樵摲NDSB的產(chǎn)生要求兩條gRNA同時(shí)靶向序列。

當(dāng)使用Cas9(D10A)切口酶和外源供體 DNA 模板將特定的堿基(例如敲入)引入感興趣的基因時(shí),也可以使用雙gRNA。在這種方法中,兩條反向的DNA鏈將被兩個(gè)gRNA靶向位于所需突變位點(diǎn)兩側(cè)的兩個(gè)位點(diǎn),然后通過HDR途徑利用外源DNA供體模板來修復(fù)切除的序列。

精選文獻(xiàn)

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