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進(jìn)一步了解 >> 我們的質(zhì)量體系通過ISO 9001認(rèn)證。這些產(chǎn)品是在我們先進(jìn)的設(shè)施中嚴(yán)格控制下生成的。

shRNA(3+1)套裝

shRNA的基因敲低效率通常在不同的shRNA設(shè)計中差異巨大,因此從多個shRNA中篩選出最佳的shRNA設(shè)計對于目的基因的表達(dá)干擾實驗尤為重要。云舟生物提供的shRNA(3+1)病毒包裝服務(wù)有助于您選擇實驗效果最好的shRNA。使用病毒載體可以高效地將這些shRNA遞送進(jìn)哺乳動物細(xì)胞。我們提供的shRNA載體病毒包裝類型包括慢病毒、AAV和腺病毒。

訂購信息

shRNA(3+1)套裝設(shè)計工具(為您目的基因定制3個shRNA載體并同時進(jìn)行病毒包裝)。

shRNA(3+1)慢病毒套裝(二代/三代慢病毒)

服務(wù)類型規(guī)格交付內(nèi)容套裝價格(CNY)周期
shRNA(3+1)慢病毒套裝制備微量規(guī)格
  • 3個定制shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,4x25 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥4,58010-19天
小規(guī)格
  • 3個定制shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,10x25 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,3x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥7,680
中規(guī)格
  • 3個定制shRNA慢病毒(每個>108 TU,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥10,080
大規(guī)格
  • 3個定制shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥15,980
超純化中規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥19,580
超純化大規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 超純化Scramble對照shRNA慢病毒(>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥23,380
miR30 shRNA(3+1)慢病毒套裝制備微量規(guī)格
  • 3個定制miR30 shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,4x25 ul)
  • Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥6,28012-24天
小規(guī)格
  • 3個定制miR30 shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,10x25 ul)
  • Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,3x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥9,280
中規(guī)格
  • 3個定制miR30 shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,10x100 ul)
  • Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥11,980
大規(guī)格
  • 3個定制miR30 shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥17,580
超純化中規(guī)格
  • 3個超純化定制miR30 shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 超純化Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥21,080
超純化大規(guī)格
  • 3個超純化定制miR30 shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 超純化Scramble miR30 shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥24,880
IPTG誘導(dǎo)型shRNA(3+1)慢病毒套裝制備微量規(guī)格
  • 3個定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,4x25 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥4,58010-19天
小規(guī)格
  • 3個定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,10x25 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,3x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥7,680
中規(guī)格
  • 3個定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>108 TU/ml,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>108 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥10,080
大規(guī)格
  • 3個定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥15,980
超純化中規(guī)格
  • 3個超純化定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥19,580
超純化大規(guī)格
  • 3個超純化定制IPTG誘導(dǎo)型shRNA慢病毒(每個>109 TU/ml,10x100 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照慢病毒(>109 TU/ml,10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
  • 聚凝胺(5 mg/ml,200 ul),贈送
¥23,380

注意:以上價格和周期包含載體構(gòu)建

點擊查看shRNA慢病毒載體指南 

點擊查看miR30 shRNA慢病毒載體指南 

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shRNA(3+1)腺相關(guān)病毒套裝

服務(wù)類型規(guī)格交付內(nèi)容套裝價格(CNY)周期
shRNA(3+1)腺相關(guān)病毒套裝制備小規(guī)格
  • 3個shRNA腺相關(guān)病毒(每個>2x1011 GC/ml, 10x25 ul)
  • Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>2x1011 GC/ml,3x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥8,58010-19天
中規(guī)格
  • 3個shRNA腺相關(guān)病毒(每個>2x1011 GC/ml, 10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>2x1011 GC/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥11,580
大規(guī)格
  • 3個shRNA腺相關(guān)病毒(每個>2x1012 GC,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>2x1012 GC/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥17,780
超純化小規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA腺相關(guān)病毒(每個>1013 GC/ml,4x25 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>1013 GC/ml,4x25 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥21,78011-21天
超純化中規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA腺相關(guān)病毒(每個>1013 GC/ml, 10x50 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>1013 GC/ml, 10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥30,180
超純化大規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA腺相關(guān)病毒(每個>1013 GC/ml,10x100 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照腺相關(guān)病毒(>1013 GC/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥42,280

注意:以上價格和周期包含載體構(gòu)建

點擊查看shRNA腺相關(guān)病毒載體指南 

點擊查看shRNA scAAV病毒載體指南 

點擊查看我們的腺相關(guān)病毒包裝詳情 

shRNA(3+1)腺病毒套裝(Ad5腺病毒)

服務(wù)類型規(guī)格交付內(nèi)容套裝價格(CNY)周期
shRNA腺病毒(Ad5腺病毒)小規(guī)格
  • 3個定制shRNA腺病毒(每個>1010 IFU/ml,10x25 ul)
  • Scramble shRNA對照腺病毒(>1010 IFU/ml,3x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥13,28034-47天
中規(guī)格
  • 3個定制shRNA腺病毒(每個>1010 IFU/ml,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照腺病毒(>1010 IFU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥19,480
大規(guī)格
  • 3個定制shRNA腺病毒(每個>1011 IFU/ml,10x100 ul)
  • Scramble shRNA對照腺病毒(>1011 IFU/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥27,680
超純化中規(guī)格
  • 3個超純化定制shRNA腺病毒(每個>1012 VP/ml,10x50 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照腺病毒(>1012 VP/ml,10x50 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥33,280
超純化大規(guī)格
  • 3個shRNA腺病毒(每個>1012 VP/ml,10x100 ul)
  • 超純化Scramble shRNA對照腺病毒(>1012 VP/ml,10x100 ul)
  • 3個定制shRNA載體,甘油菌形式
¥39,080

注意:以上價格和周期包含載體構(gòu)建

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點擊查看我們的腺病毒包裝詳情 

技術(shù)詳情

當(dāng)前我們提供慢病毒、AAV和腺病毒類型的shRNA(3+1)套裝。所有shRNA載體系統(tǒng)均經(jīng)過專門優(yōu)化,在大腸桿菌中具有高拷貝復(fù)制、可包裝產(chǎn)生高滴度病毒并且對于靶細(xì)胞具有高效的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。常規(guī)的shRNA使用人U6啟動子驅(qū)動表達(dá),在轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞中可靶向目的基因mRNA使其降解。對于AAV病毒,我們提供以下血清型:1、2、3、4、5、6、6.2、7、8、9、rh10、DJ、DJ/8、PHP.eB、PHP.S、AAV2-retro、AAV2-QuadYF和AAV2.7m8。

慢病毒載體

指南 

AAV病毒載體

指南 

腺病毒載體

指南 
文檔

暫無

常見問題解答

我們設(shè)計和評估shRNA的規(guī)則與RNAi consortium(TRC)使用的規(guī)則類似。對于每個RefSeq轉(zhuǎn)錄本,我們會搜索出所有的21 mers作為候選靶位點。以下因素會降低干擾效率/特異性或影響克隆,含有這些特點的序列將會被排除。主要因素包括:含有≥4個連續(xù)相同堿基,含有≥7個G或C,GC含量<25%或> 60%以及序列的5'端含有AA堿基。如果靶點內(nèi)部含有莖環(huán)結(jié)構(gòu),或是3'末端的GC含量較高,或是該靶點是已知的miRNA核心序列或是會打靶到其他基因,則該靶點的分值就會較低。若靶位點存在于一個基因的多個轉(zhuǎn)錄本,則該靶點的分值就會較高。 所有的干擾分值均≥0,平均數(shù)約為5,標(biāo)準(zhǔn)差約為5,95%的分值均≤15。若一個shRNA的干擾分值是15,則表示具有很高干擾效率且易于克隆;若干擾分值為0,則表示干擾效果較差或難以克隆。

請注意干擾分值只是一個參考值。實際的干擾效果可能會與預(yù)測的分值有偏差,低分值的shRNA也可能產(chǎn)生較好的干擾效果。同時,靶向轉(zhuǎn)錄本的 3’ UTR也可以起到干擾作用。

并不是所有的shRNA都會起作用

根據(jù)我們的經(jīng)驗和來自客戶的反饋,使用3-4個shRNA進(jìn)行干擾測試時,通常只有2-3個有比較合理的干擾效果。所以,在使用shRNA時,重要的是要認(rèn)識到并非所有的shRNA都能正常工作。通常情況下,約50-70%的shRNA具有干擾效果,其中只有約20-30%的shRNA具有比較明顯的效果。如果您使用幾個shRNA靶向同一個基因都沒有一個能產(chǎn)生滿意的干擾效果,最好的解決方式是嘗試更多的shRNA,特別是那些經(jīng)過文獻(xiàn)驗證的shRNA。目前,許多研究人員使用靶向相同基因的shRNA庫(即不同shRNA的混合物)進(jìn)行實驗,以期提高干擾效率。

干擾效率檢測方法不當(dāng)

最常用評估shRNA干擾效率的靈敏測定方法是RT-qPCR,您可能需要嘗試幾對引物,篩選出最具特異性和效率的引物對。通常情況下,RT-qPCR引物應(yīng)跨越內(nèi)含子,即設(shè)計在兩個外顯子上,以免擴增基因組DNA。當(dāng)使用新引物時,建議您先進(jìn)行預(yù)擴增實驗,并將PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測目的條帶,或者甚至可以通過測序驗證PCR產(chǎn)物是否正確。在進(jìn)行RT-qPCR的同時,應(yīng)注意設(shè)置minus-RT對照以評估基因組DNA的污染水平。您可以使用NCBI引物設(shè)計工具(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/)來檢查引物質(zhì)量。 干擾效率也可以通過蛋白質(zhì)印跡法(Western blot)進(jìn)行評估。然而,該方法常產(chǎn)生來自非特異性抗體結(jié)合的假陽性條帶,從而導(dǎo)致誤判沒有干擾效果。因此,在使用時需要確??贵w的特異性。 您使用的shRNA可能只打靶基因的某個轉(zhuǎn)錄本 在設(shè)計shRNA時,我們推薦您使用那些能靶向單個基因多個轉(zhuǎn)錄本的shRNA,除非您只想打靶特定轉(zhuǎn)錄本。VectorBuilder提供針對常見物種的shRNA數(shù)據(jù)庫。當(dāng)您將shRNA元件插入載體時,您可以選擇shRNA數(shù)據(jù)庫,通過搜索目的基因查看所有可用的shRNA詳細(xì)信息。您還可以打開其中的UCSC鏈接,查看shRNA序列在基因組和轉(zhuǎn)錄本中位置等信息。

您使用的shRNA可能只打靶基因的某個轉(zhuǎn)錄本

在設(shè)計shRNA時,我們推薦您使用那些能靶向單個基因多個轉(zhuǎn)錄本的shRNA,除非您只想打靶特定轉(zhuǎn)錄本。VectorBuilder提供針對常見物種的shRNA數(shù)據(jù)庫。當(dāng)您將shRNA元件插入載體時,您可以選擇shRNA數(shù)據(jù)庫,通過搜索目的基因查看所有可用的shRNA詳細(xì)信息。您還可以打開其中的UCSC鏈接,查看shRNA序列在基因組和轉(zhuǎn)錄本中位置等信息。

生物醫(yī)學(xué)研究中慢病毒、AAV以及腺病毒都是常用的病毒載體,它們在應(yīng)用以及性能上各有優(yōu)劣。

下表是當(dāng)您選擇合適病毒時需要考慮的因素:

 慢病毒AAV腺病毒
組織嗜性廣泛取決于血清型難以感染某些細(xì)胞
是否可感染非分裂細(xì)胞
病毒基因組穩(wěn)定整合抑或游離于宿主基因組穩(wěn)定整合游離的DNA附加體形式游離的DNA附加體形式
最大滴度很高
自定義啟動子
應(yīng)用體外、體內(nèi)實驗體內(nèi)實驗體內(nèi)實驗
體內(nèi)免疫反應(yīng)很低

從細(xì)胞收毒后,如果病毒載體帶有熒光報告基因,我們通常先將病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)一些常見的細(xì)胞系(如293T或293A),觀察熒光的表達(dá)情況,從而檢驗病毒的質(zhì)量。然后根據(jù)病毒類型采取不同的方法來量化病毒的滴度。如果熒光觀察結(jié)果和定量測量之間存在較大差異,我們將進(jìn)行重新測量或額外驗證,以確保生產(chǎn)的病毒是高質(zhì)量的。

慢病毒

我們使用p24 ELISA法測定慢病毒滴度。該方法的三明治免疫試驗可測定HIV-1核心蛋白p24在慢病毒上清液中的含量水平。我們首先在微量滴定板上加入慢病毒樣本,然后每孔加入HIV-1 p24捕獲抗體進(jìn)行孵育,并隨后添加生物素化的p24二抗以結(jié)合p24一抗。此后,樣本中加入的辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的鏈霉親和素可特異性結(jié)合生物素化的p24二抗。在最后一步中,加入辣根過氧化物酶底物反應(yīng)液,經(jīng)HRP催化產(chǎn)生有顏色的產(chǎn)物。每個孔的顏色深度最終反映了慢病毒樣本中的p24含量。使用分光光度計測量的樣本吸光度數(shù)值與重組HIV-1的p24標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行對照,然后被換算為對應(yīng)的慢病毒滴度。

AAV

我們通過裂解AAV病毒顆粒,然后以qPCR測定裂解產(chǎn)物中的AAV基因組拷貝數(shù)(ITR區(qū)域的拷貝數(shù))來獲取AAV的物理滴度(Physical titer)。AAV病毒顆粒通常十分穩(wěn)定。我們制備的AAV均有活性且能在室溫下多天仍保持功效。因此我們的物理滴度非常接近實際的功能滴度。

腺病毒

對于腺病毒,我們測量的是功能滴度(Functional titer)。在293A細(xì)胞中轉(zhuǎn)導(dǎo)梯度稀釋的腺病毒后,我們使用我們采用基于免疫化學(xué)的方法對轉(zhuǎn)導(dǎo)成功的細(xì)胞進(jìn)行計數(shù)來代表病毒滴度。這些細(xì)胞包含了腺病毒特異性六連體蛋白(Ad5 hexon protein),并且每個細(xì)胞被看作一個感染單位。細(xì)胞在非常低的感染復(fù)數(shù)的條件下被轉(zhuǎn)導(dǎo),以保證每個細(xì)胞只被一個腺病毒感染。這種實驗方法與傳統(tǒng)的噬菌斑試驗有良好的相關(guān)性。對于超純化的腺病毒,我們通過測定病毒顆粒的光密度(OD260)來換算為滴度(光密度與病毒的功效滴度有良好的相關(guān)性)。腺病毒具有相當(dāng)好的穩(wěn)定性。我們制備的腺病毒在室溫下保存多天仍具有活性。

載體設(shè)計
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